Esse comportamento descrito é muito estranho.
Descreves que analisas-te a parte elétrica e não encontras nada de anormal, se assim for só pode ser pode ser um problema mecânico, neste caso relacionado com embraiagem ou carburador. Contudo desconfio bastante que o problema está mesmo no sensor da velocidade engrenada, que não tem só a função de informar o CDI que a mota está em ponto morto, mas também informa em que mudança da caixa vai engrenada.
Faz uma experiência, coloca a mota no cavalete central com o motor a funcionar, verifica o funcionamento do motor quando engrenas uma mudança.
Aproveita e verifica se a embraiagem depois de teres a mudança engrenada e ao apertar a mante a roda de trás para ou continua a rodar com alguma força.
Depois dá o teu feedback